Para poder promover una gestión descentralizada y más participativa del CBLS, el Comité Local determinó seguir el modelo de subcorredores promovido por el Corredor Biológico Volcánica Central – Talamanca y que ha sido replicado por otros CB dentro y fuera del país (CBLS 2016). Los subcorredores son unidades territoriales más pequeñas definidas a partir de condiciones paisajísticas, productivas y sociales (Canet-Desanti 2008). De esta forma, el Corredor Biológico Los Santos fue dividido en cuatro subcorredores o sectores: i) Central, ii) Reserva Forestal Los Santos, iii) Los Llanos y iv) Acosta – Puriscal. De estos, el Sector de la Reserva Forestal Los Santos es el de mayor tamaño con 60.989 ha, que equivalen al 41% del CB; mientras que el Sector Central es el más pequeño con 14.900 ha, que equivalen al 10% del CB.